Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl9F7BE40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl9F7BE40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms