Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms