Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3072F6SKY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms