Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf4E9QAP7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf4E9QAP7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms