Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep350E9Q309 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep350E9Q309 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms