Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E430018J23RikE9PZQ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E430018J23RikE9PZQ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E430018J23RikE9PZQ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E430018J23RikE9PZQ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E430018J23RikE9PZQ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms