Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcom1E9PZ54 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms