Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc175E9PVB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms