Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb5B5X0E4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb5B5X0E4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms