Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cped1B2RX70 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms