Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr16A3KMN5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr16A3KMN5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms