Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd5A2A8L1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd5A2A8L1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms