Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71e1A1L3C1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms