Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms