Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Krt20Q9D312 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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