Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms