Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shq1Q7TMX5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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