Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Znf608Q56A10 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf608Q56A10 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms