Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RPL17P10-201ENST00000416091 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC012339.1-201ENST00000505564 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 REST-205ENST00000611211 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms