Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms