Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms