Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms