Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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