Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc38Q8CDN8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms