Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms