Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin1Q61644 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms