Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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