Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms