Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm5460Q3UQ97 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm5460Q3UQ97 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm5460Q3UQ97 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5460Q3UQ97 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5460Q3UQ97 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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