Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms