Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atp5bP56480 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms