Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEMP55040 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEMP55040 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEMP55040 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEMP55040 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms