Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18525 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18525 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18525 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms