Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms