Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Opn1mwO35599 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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