Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm4340L7N2C4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4340L7N2C4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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