Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms