Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr61Q9ERF3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr61Q9ERF3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms