Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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