Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms