Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms