Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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