Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms