Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Hddc3Q9D114 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hddc3Q9D114 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hddc3Q9D114 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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