Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bhlhe41Q99PV5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms