Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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