Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Gm9955Q8CEJ8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Gm9955Q8CEJ8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Gm9955Q8CEJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Gm9955Q8CEJ8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Gm9955Q8CEJ8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm9955Q8CEJ8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Gm9955Q8CEJ8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Gm9955Q8CEJ8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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