Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms