Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nbr1P97432 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms