Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r167G3UW71 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms